西藏阿里地区藏医医院创建于1984年，其前身为地区人民医院藏医科，是集医疗、教学、科研、预防保健、藏药制剂 为一体的二级甲等藏医医院。

医院开设内科、心脑血管科、外治科、风湿专科、治未病科，其中国家级重点专科1个， 有制剂中心、藏医药天文历算研究中心、冈底斯藏医学校3个所属科室，研发多种具有区域特色的药品。